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	黑潮漁業數位典藏　臺灣東部黑潮漁業文化數位典藏		臺灣東部海域屬於活動大陸邊緣及海洋板塊交界處，海底地形陡峭特殊，多樣化且特殊的海洋環境與水文型式，豐富了臺灣東部海域黑潮流系魚類的多樣性，不僅洄游性魚類資源豐足且礁岩性底棲性魚類種類亦繁多。黑潮形成的各種洄游性魚類的漁場，造就了臺灣東部的海洋漁業，發展出多樣性的漁撈技術，育養了東部漁村無數世代的子民，帶動了地方經濟活絡，進而形塑了漁村組織與各式各樣的漁村習俗文化。水產試驗所東部海洋生物研究中心保存了各種東部黑潮流域各種漁具漁法的相關文獻、照片與影帶以及黑潮漁村文化的演變與繁榮過程，同時現有典藏東部海域魚類標本達2,000 餘件。本計畫針對臺灣東部黑潮漁業文化進行數位典藏，預計完成：（1）黑潮流系魚類相及魚種基本解說之資料庫建置；（2）黑潮海域漁具漁法資料及日治時代總督府水產試驗場調查研究文獻數位化典藏；（3）黑潮漁業文化數位化展示等三大類工作，並將上述資料透過網際網路提供漁業推廣教育或加值服務等利用。
	沿近海標本數位典藏　台灣沿近海海洋生物標本之數位典藏--魚、貝、甲殼類		水產試驗所自 1929年成立後，對於台灣周圍海域的生態與水產生物資源的調查不遺餘力，也因此典藏了許多珍貴的水產生物標本。本計劃以三年期間，將本所標本室長期累積的實體標本進行整理，並結合影像處理技術，建構成數位化的資料庫，以供研究、展示、教育與民生經濟用途。標本包括魚、貝、甲殼類。在魚類方面係由本所試驗船長期進行各種調查的漁獲物，並輔以魚市場調查蒐集的標本為主，少數來自日據時代遺留或漁民贈送的標本，範圍遍及台灣沿近海及澎湖、東沙、南沙太平島等海域，標本數達3300件以上。
	水產生物圖說		包含有: 1. 台灣常見的大陸水產品圖說由81及82年度連續兩年調查的結果，共計採獲大陸走私水產品九十種，約一千隻標本，其中魚類六十八種、貝類十種、甲殼類七種、軟體動物五種。 2. 總所水族館魚類本所基隆總所水產研究大樓一樓大型環流水槽及小型分隔水槽之魚類。 3. 南中國海魚類圖說(I) 依據七十四年度計畫實施調查南中國海所產之魚類六十種，係由本所海富號與海建號試驗船所採集者，其魚法為底立繩釣與浮流刺網等。本書各種魚類均附彩色圖片，並列舉中名、學名、科名、英名、俗名、形態、分佈、生態、利用等。 4. 澎湖的蟹類澎湖群島位於台灣海峽之中央，島嶼羅列，生態環境獨樹一格。棲地環境從潮間帶的珊瑚淺坪、礫灘、沙質海灘、泥灘地、紅樹林及潮池，到潮下帶以深的岩礁、珊瑚礁或沙質的海底，相當多樣性，棲息其間的蟹類物種也極為豐富。本單元共蒐羅22科143種蟹類，每種蟹類均詳列其同種異名、型態特徵、頭胸甲寬、性別、棲所、生態習性、採集或觀察地點與世界分布情形，除提供民眾與專家有關澎湖蟹類的相關資訊外，並促使其對澎湖海洋生物的多樣性有進一步的認識。

	東部中心水生館		民國90年開幕的台東水族生態展示館，隸屬於本所東部海洋生物研究中心，位於台東縣成功鎮新港漁港旁，館內特色在於展現東部海洋與漁業的特色。94年委託國內知名的企業經營（國立台東海洋生物展覽館），期能以水產科技研究及海洋教育之功能，帶動台東地區觀光事業之發展及繁榮。水族生態展示館委外經營案，雙方契約於97年8月5日終止。本所為維持水生館之社教功能及維護社會大眾權益，乃轉型為研究型水族館並增加小丑魚主題館，採公辦公營方式於98年5月15日開幕，將本所的海水觀賞魚研究延伸至本館，除了可以提升海水觀賞魚養殖環境條件外，更讓民眾近距離接觸這些海水觀賞生物，進而認識與保育牠們，如此對維護海洋資源永續利用及減少人為不當捕撈，將會有正面助益。
	澎湖水族館		澎湖水族館位於澎湖縣白沙鄉岐頭村，隸屬於本所澎湖海洋生物研究中心，佔地約3000餘公頃，為國內首設結合科技研究、社會教育及觀光遊憩等設計功能的水族館。水族館位在澎湖白沙鄉白沙養殖場內，距馬公市區路程約十五公里，面積約有二公頃半，建館面積四千六百九十平方公尺，分為二層，規劃瞬間最大容量為五百人，展示包括了以澎湖群島為中心，半徑二百公里內的海洋生物。澎湖水族館目前已有兩百餘種，預計擴充至四、五百種澎湖及臺灣地區海域魚類供民眾參觀，以規模和蒐藏展示品質來說，已經達到國際級水準，傲視東南亞國家的水族館，因此十分有看頭，同時長達二十餘公尺的海底隧道、大洋池、親水池與靜態展示等，都可提供民眾一處休閒參觀與吸收知識的據點。