| 臺灣北部海域斑節蝦漁業資源生態調查 | 莊世昌、蕭聖代、金建邦 | 2021 |
| 臺灣北部海域鎖管漁業生態調查及預測模式 | 張可揚、陳玉姬、劉康熙 | 2021 |
| 臺灣西南海域白腹鯖生殖特性調查 | 何珈欣、吳伊淑、鄭力綺、黃星翰、陳秋月、黃婉綺、楊錦樺、翁進興 | 2021 |
| 臺灣西南海域拖網漁業資源生態調查 | 陳郁凱、何珈欣、吳伊淑、黃建智、黃星翰、陳秋月、黃婉綺、楊錦樺、翁進興 | 2021 |
| 臺灣周邊海洋生態長期監測站與國際合作 | 嚴國維、連韋翔、潘佳怡、曾秀茹、蘇博堃 | 2021 |
| 臺灣周邊海域漁場環境監測 | 嚴國維、潘佳怡、曾秀茹、蘇博堃、陳瑞谷 | 2021 |
| 臺灣東部海域矛尾翻車魨營養位階動態解析研究 | 劉祐瑜、張景淳、張綦璿 | 2021 |
| 臺灣東部海域鬼頭刀延繩釣季節性漁場分布 | 林憲忠、江偉全、王勝平、何源興 | 2021 |
| 臺灣東部海域黑皮旗魚季節性垂直洄游行為解析 | 江偉全、林憲忠、張綦璿、蔡富元、許紅虹 | 2021 |
| 臺灣沿近海帶魚屬魚類之生殖生物學暨漁業活動熱點之魚種組成研究 | 曾正豪、吳允暉、金建邦、鄭力綺、黃星翰、劉康熙、陳人裕、羅方君 | 2021 |
| 臺灣海域正鰹族群結構、生殖生物學及營養階層動態解析 | 張芸甄、江偉全、陳律祺、葉宇庭、林綉美、歐麗榛、孫靖婷、莊美英、吳瑞賢、許紅虹、蔡富元 | 2021 |
| 離岸風電潛力場域漁業生態變動之研究 | 李純慧、陳均龍、莊世昌、蔡孟昌、蘇博堃、潘佳怡、陳人裕、曾秀茹、李茂熒、張可揚、劉康熙、葉信明 | 2021 |
| 人工藻場技術開發與應用 | 葉宇庭、冼宜樂、林綉美、方鵬和、歐啟明、劉再豐、陳岳川、蔡忠和、楊子泰、歐麗榛、陳俊廷、謝恆毅 | 2020 |
| 矛尾翻車魨生殖生物學特徵研究 | 張綦璿、許紅虹、張景淳、江偉全、蔡富元、吳瑞賢、林憲忠 | 2020 |
| 因應氣候變遷我國境內漁業生產調適行動方案之研擬 | 賴繼昌、侯清賢、張致銜、黃星翰、周慈慧 | 2020 |
| 近年臺灣沿近海烏魚漁獲資源變動情形 | 張致銜、黃建智、賴繼昌、黃星翰、翁進興 | 2020 |
| 苗栗離岸風場內牡蠣養殖試驗 | 藍揚麒、翁進興 | 2020 |
| 桃竹苗離岸風電潛力場域漁業型態與漁獲物調查 | 李純慧、蘇楠傑、黃莉鈞、林宥燊、鄭君亜、林威任 | 2020 |
| 氣候變遷對於太平洋海域翻車魨科魚種食物網之動態模型預測 | 張景淳、張綦璿、江偉全、許紅虹、蔡富元、林憲忠 | 2020 |
| 康氏馬加鰆日夜間垂直洄游 | 何珈欣、黃建智、賴繼昌、藍揚麒、陳秋月、黃星翰、張致銜、翁進興 | 2020 |