| 台南縣北門內灣養殖區水質環境調查研究 | 李榮涼、陳敏隆、丁雲源 | 2003 |
| 甲狀腺素對人工孵化日本鰻發育及活存率之影響 | 陳冠如、張湧泉、董聰彥、賴仲義、劉富光 | 2003 |
| 甲殼素增進吳郭魚免疫能力之研究 | 黃世鈴、楊豐隆、劉富光 | 2003 |
| 石斑魚血液血清臨床診斷技術之研究 | 張正芳、楊佳宏、許家惠、陳紫媖 | 2003 |
| 石斑魚飼料誘引物質研究 | 丁雲源、吳豐成、陳敏隆、張丁仁 | 2003 |
| 石斑魚類種原保存相關技術之研究 | 葉信利、朱永桐、許晉榮、丁雲源 | 2003 |
| 石斑變態過程消化系統及甲狀腺之研究 | 許晉榮、葉信利、朱永桐、丁雲源、黃國彰、胡益順、梁 | 2003 |
| 自動化養蝦系統的應用研究-白蝦優良品系大量培育 | 林明男、邱靜山、曾寶順 | 2003 |
| 貝類種苗生產自動化之研發-牡蠣初期浮游苗自動培育技術之研發 | 何雲達、周麗梅、黃麗月、陳鴻議、戴仁祥、丁雲源 | 2003 |
| 近紅外光技術應用於水產飼料摻雜之檢測 | 藍惠玲、賴志行、郭淑貞、王文政、吳純衡 | 2003 |
| 雨水對蝦池養殖環境變化之探討 | 李榮涼、邱英哲、林世榮、丁雲源 | 2003 |
| 室內箱網自動化養蝦室內心研1號(舊式)及2號(新式)六層箱網之比較 | 林明男、葉俊億、丁雲源 | 2003 |
| 枯葉紫雲蛤之解剖學與人工繁殖之初步研究 | 戴仁祥、丁雲源 | 2003 |
| 降雨對蝦池水質及草蝦養成之影響探討 | 郭世榮、林明男、丁雲源 | 2003 |
| 海洋光合成細菌之培養及應用於輪蟲培養之初步研究 | 朱永桐、葉信利、許晉榮、丁雲源 | 2003 |
| 海鱺不同成長階段對脂質之需求及利用 | 周瑞良、何碧月、鄭世榮、陳紫媖 | 2003 |
| 海鱺中間育成階段品質強化技術之建立 | 周瑞良、何碧月、張正芳、鄭世榮、陳紫媖 | 2003 |
| 海鱺的攝餌促進劑開發研究 | 劉栢興、陳紫媖 | 2003 |
| 海鱺對礦物鹽之需求及利用研究 | 何碧月、周瑞良、鄭世榮、陳紫媖 | 2003 |
| 臭氧在水產養殖之應用研究探討以臭氧處理改進養殖池供水及放流水之水質 | 謝介士、葉瑾瑜、陳紫媖 | 2003 |