| WSN 技術應用於澎湖海域棲地生態與產業環境之監測與分析(IV) | 呂逸林、謝恆毅、張戴陽、郭彭、林志遠 | 2016 |
| 三間雀鯛繁養殖技術研發 | 鄭明忠、江玉瑛、何源興 | 2016 |
| 大頭白姑魚生殖特性調查 | 何珈欣、吳伊淑、蕭琍婷、陳羿惠、黃星翰、張麗美、陳秋月、黃建智、賴繼昌、吳龍靜 | 2016 |
| 小眼花簾蛤繁養殖技術研究(III) | 黃麗月、陳鴻議、陳燈煌、葉信利 | 2016 |
| 分子標誌輔助九孔育種之應用(II) | 杜金蓮、曾福生、阮雅莛、劉大維 | 2016 |
| 水產副產物作為保骨素材之研發(II) | 蔡慧君、杜明杰、蔡儀冠、蔣淑嫻 | 2016 |
| 水產資訊智慧化平台多元服務之研究(III) | 徐雅各、李周陵、曾振德、林志遠 | 2016 |
| 水產種原庫多功能建置及科技產業化應用 | 曾福生、杜金蓮、蔡惠萍、陳鏗元、張格銓、謝恆毅、張錦宜、許晉榮 | 2016 |
| 水產養殖企業管理之動態物聯網系統研發建置 | 張致銜、林志遠、黃奇安 | 2016 |
| 水產養殖智慧節源系統之整合開發與建置(II) | 林志遠、黃奇安、陳永欣、張致銜、楊順德 | 2016 |
| 水產機能成分對改善骨質之影響 | 吳純衡、蔡慧君、蔡儀冠、杜明杰、陳柏璇 | 2016 |
| 牛磺酸添加對點帶石斑甲硫胺酸需求之節約效果 | 周瑞良、鄭世榮、陳盈達、陳紫媖 | 2016 |
| 以抗菌胜肽重組蛋白提升魚類免疫力之研究 | 黃美瑩、陳力豪、曾亮瑋、張錦宜 | 2016 |
| 以納豆菌發酵海帶之發酵產物功能性評估 | 高淑雲、易琮凱 | 2016 |
| 以動物實驗評估魷魚皮微脂體加速緩解發炎之功效 | 高翊峰、李緯毅、吳純衡 | 2016 |
| 以魚肝臟細胞評估移除羥四環黴素的可行方法 | 郭錦朱、張博淵、趙崇宇、林冠宏、賴哲翊、陳紫媖 | 2016 |
| 生態水培系統之研究(II) | 黃德威、劉于溶、楊順德 | 2016 |
| 白蝦種原保存與高生殖高成長選育 | 楊明樺、曾國榮、吳秉儒、鄭金華、陳紫媖 | 2016 |
| 石斑魚養殖模場技術之建立(III)－模場大型苗生產技術之建立 | 陳陽德、朱永桐、張丁仁、吳承憬、邱靜山、黃政軒、葉信利 | 2016 |
| 全雌化烏魚種苗繁殖技術之研發 | 李彥宏、陳紫媖 | 2016 |