睽違3年多，農委會水產試驗所的澎湖水族館經促參公司澎博海洋科技投入超過4000萬元資金及大量人力的努力，已於近日完成整建。澎博公司特地邀請澎湖在地官員、民意代表、新聞媒體及水試所人員在8月15日下午舉辦別開生面的「平安祈福 擁抱海洋」活動，預告水族館8月16日重新開放，同時進行營運的改善精進，並將於明年4月間舉辦盛大隆重的開幕儀式，以增色明(108)年的澎湖觀光季，歡迎各界舊雨新知入館遊覽，體會澎湖美麗的海底世界。
澎湖擁有蔚藍的天空、碧綠的海水及獨特天然景觀，近年並獲最美麗的海灣美譽，而其豐富的海洋生物及水產是澎湖的另一特色，也因此，水試所從民國80年即以近7億元經費與6年時間進行澎湖水族館的籌建，於87年4月正式對外營業，並於93年引進民間投資促參，先後有南仁湖企業及大東山企業參與經營。大東山於103年底主動申請解約後，水試所鑒於場館設備需行整修與更新，除一方面進行展示生物的照養與管理，同時進行整建工作，並重啟促參招商工作，此期間水族館未開放參觀。
澎博海洋科技公司於105年間依促參法第46條規定以自提促參(OT+ROT)案方式向水試所主動提出水族館經營之申請，經評選後於106年6月23日與水試所簽約，旋即投入第一期的整建工作，8月16日即將呈現該公司與水試所合作下所賦予澎湖水族館的新風貌。
水試所借重澎博公司承攬許多國內外知名水族館維生系統及豐富蓄養展示生物的經驗，除將澎湖水族館改頭換面，未來續將投入二期計畫，擴大展示活動空間與互動介面，相信將持續吸引更多的遊客來澎湖觀光，成為來澎湖必遊景點之一，成為帶動澎湖觀光業發展的重要支柱，達成水族館設立最初的「科技研究」、「社會教育」及「觀光遊憩」三目標。