本所多年來致力於建立對環境友善的水產養殖模式，研發出改良型的創新魚菜共生系統，可同時生產淡水魚類、觀賞蝦、螺類及植栽作物，在一般的魚菜系統中，加裝培養藻、菌的特殊方式，運用藻、菌等微生物充分吸收利用養殖水的營養元素，再將所產生的藻、菌做為餌料餵飼觀賞蝦類及螺類，可提升九成以上的水循環利用率，並可增加約一倍的產值，有效提升系統的產值與利用性。