近年來牡蠣走私猖獗，嚴重打擊台灣本土牡蠣養殖產業，本所正著手建立台灣本島野生及養殖牡蠣的DNA生命條碼資料庫，以協助業者進行牡蠣養殖管理，並作為海關查緝與鑑定走私牡蠣來源的依據，共同維護本土牡蠣產業以及養殖戶和消費者的權益。