為解決九孔苗落板及養殖九孔大量死亡問題,本所利用所建立的九孔分子標誌生物技術,輔導業者篩選親緣較遠的養殖九孔或野生九孔,進行遠緣雜交育種,已顯著改善種苗及種貝品質,經過5年連續追蹤結果,育成之幼苗或成貝,成長與活成率均佳,成效顯著,大幅改善九孔產業問題。