本所透過種原庫設施及研究人員的努力，成功保存並穩定繁殖高體鰟鮍 (Rhodeus ocellatus ocellatus)、青鱂 (Oryzias latipes)、蓋斑鬥魚 (Macropodus opercularis)、條紋二鬚鲃 (Puntius semifasciolatus)、史尼氏小鲃 (Puntius snyderi)、羅漢魚 (Pseudorasbora parva) 等10種臺灣本土淡水魚種，預期可應用於食用、休閒觀賞、藥用、教學、生物防治以及污染排放檢測等領域。