水域中的環境DNA (environmental DNA, eDNA) 係指水體中所發現的遺傳物質。最近研究人員以即時定量PCR (realtime qPCR) 方法，提升了判定的靈敏度與專一性。Takahara等使用即時定量PCR，再根據水族缸與試驗池中所測得eDNA濃度與生物量正相關的比例，推估出自然潟湖中鯉魚的生物量。