本所水試二號試驗船自啟用後，成為執行各項試驗研究計畫的最佳利器，船上配備多項先進聲學探測儀器，如全向性掃描聲納 (SIMRAD SP90)、淺海多波束聲納 (SIMRAD ME 70) 及多頻率的科學魚探 (SIMRAD EK-60 38/120/200 kHz Spilt Beam System)，使蒐集到的資料能得到更精密及更多面向的分析。以下簡單介紹部分聲學設備之利用現況。