臺灣四面環海，貝類生物資源豐富，其中具有經濟價值的二枚貝有牡蠣、血蚶、孔雀蛤、日月貝、竹蟶、西施舌、文蛤、花蛤、淺蜊、小眼花簾蛤、山瓜子簾蛤及馬蹄蛤等。但因過度捕撈與棲息環境過度開發等因子，除少數有人工繁養殖者外，天然資源已有不少種類幾乎瀕臨絕跡。又加上近年全球暖化，極端氣候因子，如暴雨、寒害和高溫等對這些資源造成瀕絕的嚴重威脅，如不及早進行保種工作，可能有滅種的疑慮。因此本所逐步計畫收集臺灣現有具經濟價值、食用與觀光的臺灣經濟貝種，期以建立繁殖幼苗方法來進行資源復育，並改良品種供產業養殖與利用。