跳到主要內容區塊

魚類腸道菌相分析利器-聚合酶連鎖反應-變性梯度膠體電泳

  • 出版日期:106-03-01
  • 點閱數:239
  • 修改時間:108-06-13

腸道菌相的組成及其優勢菌群對動物的健康及成長影響至鉅。傳統上分析魚類之腸道菌相,是以基礎培養基 (basic medium) 及選擇性培養基 (selective media) 初培後,由細菌形態進行單顆純化培養,繼之以顯微鏡觀察或鑑別培養基 (differential media) 進行簡單分類或直接送定序。然而這種觀測微生物多樣性的方法有許多重大的缺陷;其一,魚類腸道微生物環境相當複雜,不但受到免疫系統與攝入食物等之影響,微生物間彼此也會產生交互作用,另外還有許多未查明的影響因子。這些因素會因時地而異,難以用人工培養方法重現。根據文獻報導,高達90% 以上的細菌無法以人工培養 (徐,2006),再加上海洋是個廣袤多樣的生態系,科學家迄今所探究的海洋細菌種類甚至不到總數的5% (孫,2013),因此合理推測魚類腸道內可能存在無法以傳統方法培養及鑑定的菌種。其二,顯微鏡下所觀察到的腸道菌,只能判斷其表現型 (phenotype),但是許多表現型在不同環境下亦有所差異,這樣的不穩定性或許會增加誤判的可能性,相對之下,基因型 (genotype) 顯得較為可靠,尤其目前分子生物技術進展快速,以基因型作為菌種的判斷依據將是更好的方式。