民國34年10月，臺灣光復，本所正名為「台灣省水產試驗所」直 屬行政長官公署，並依據組織規程設庶務科，綜理庶務工作，民 國37年間改隸屬「農林股份有限公司」，38年10月又奉令改制隸屬於「台灣省政府農林廳」，並由省政府頒佈修正組織規程，改設總務課，分置文書、庶務及出納等 3股，分別辦理總務有關事宜。嗣於62年 6月為健全組織功能，改設總務室，裁併出納股， 並將其業務歸併於事務股，目前本室依據組織規程置主任及文書 、事務 2股，綜理有關文書、檔案、事務、出納、財產、廳舍及 工友等管理事宜。