(1)對已規劃為資源保護區之海域，列為拖網漁船禁漁區，並在各漁區及保護區所在地，詳細公佈禁漁區之範圍與管理辦法，並加強宣導使漁民知悉資源保護的重要性。(2)建造巡邏船加強取締電、炸、毒等非法漁業，並依法嚴辦。(3)建立海水污染監測體系與防治辦法，並積極改善已污染河川及沿岸水域水質與環境。(4)成立效益調查評估小組，逐年進行調查評估保護區之資源狀態，以憑改善。