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箱中之砂石有利於硝化細菌附著、繁生，水質可維持穩定。硝化細菌分兩類：將氨氧化成亞硝酸根離子者及將亞硝酸根離子氧化成硝酸根離子者，氨及亞硝酸根離子對水族均具有毒性，硝化細菌可將其氧化成無毒的硝酸根離子。