端腳類屬於甲殼類之浮游動物，清除方式以使用有機磷劑 (三氯松殺蟲劑為主，如地特松、殺滅松、馬速展等)，ㄧ般使用劑量為0.2－.5 ppm。但若是發生在池中有石斑魚卵孵化之情況下，這些化學藥物會影響到卵胚胎之發育。尤其在高溫 (30℃以上) 下，三氯松很快分解為高毒性之二氯松，影響胚胎發育更甚。
一、處理方法
1.收集魚卵以清水沖洗，並以浮游生物網過濾。
二、預防方式
1.清池後應除去底部之有機物污泥，並以漂白水50－100 ppm消毒，曝晒2週以上，以殺除端腳類之耐久卵。
2.孵化魚卵使用之飼育海水須先經沙層或浮游生物網過濾。
3.石斑魚卵之孵化時間約需一天，需要利用之池子之面積也較小，故孵化魚卵使用之飼育池與育苗池最好分開。在魚卵孵化前，飼育池先做水培養浮游生物，魚卵孵化後再將魚苗放入飼育池蓄養，如此可防止端腳類干擾魚卵之孵化，又可達事先培養魚苗餌料生物之目的。
4.若是種魚場為供應受精卵之業者，在受精卵收集後，須以乾淨海水清洗，避免產卵池中之浮游動植物附著於魚卵上，影響魚卵之孵化率。