所謂的腐植酸指的是能夠溶在強鹼溶液中的物質，但一般市售的腐植酸係指以氫氧化鉀或是氫氧化鈉去溶解泥煤而產生的黑色黏稠物質。使用氫氧化鉀者就是所謂的腐植酸鉀，而使用氫氧化鈉者，則是腐植酸鈉，但均通稱為腐植酸。真正的腐植酸是從有機物質來的，和使用泥煤或褐煤用強鹼去萃取出的腐植酸的功能差異很大。腐植酸本身屬於酸性，能夠緩慢釋放腐植酸與黃腐植，使pH值下降至平衡狀態。
環境保護署「地面水體分類及水質標準」第2條規定之養殖用水質分為：一級水產用水：在陸域地面水體，指可供鱒魚、香魚及鱸魚培養用水之水源。
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分級
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基準值
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氫離子濃度指數(pH)
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溶氧量 (DO)
PPM
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生化需氧量 (BOD)
PPM
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氨氮
(NH3-N)
PPM
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乙
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6.0-9.0
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5.5以上
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2以下
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0.3以下
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水體的分布和變化對於生物圈的發展演化具有重大意義，其中水體氫離子濃度指數 (pH值) 的恆定性又是最重要的關鍵。大部分的水生生物均對水環境中pH值的變動相當敏感，研究指出，當pH < 5時，魚群會相繼死亡，因此，環保署基於維護生態平衡的考量，訂定放流水排放標準，其中特別規定pH值排放標準為6.0－9.0，以防止對水生生物的生存造成衝擊，繼而影響食物鏈的循環。
一般養殖用pH值應在6.0－9.0之間，pH值會因藻類行光合作用及殘餌、死藻、排泄物等之堆積腐敗而有所變動。午後3－5時陽光強，光合作用最盛，故pH值最高值，晚間無陽光時藻類改行呼吸作用，pH值會降低。pH值過高時，藻類繁殖旺盛，池水過肥，應適時注入新水，排出舊水，以沖淡pH值，以免藻類異常繁殖後會迅速死亡，以致污染水質。
亞硝酸離子藉由氯細胞的協助穿透鰓進入魚體，在血液中亞硝酸與血紅素 (HB) 結合，變成變性血紅素 (methaemoglobin, metHB)，使血液運送氧的能力下降，metHB為棕色的，血液中metHB的量增加使血液及鰓變成棕色，故亞硝酸中毒又稱為「棕血症」 (brown blood desease) (Svobodová, 1991)。
亞硝酸為一種極弱酸，其來源為氨之氨化作用所生成，在pH值低，亞硝酸的毒性會增加造成血紅素運送氧功能降低阻礙生理功能其安全濃度在0.5 ppm以下，適當的水色、藻類可吸收亞硝酸鹽類或藉硝化細菌之脫氧作用而分解為無毒性的NO3或N2。另外全天候開啟水車，增加養殖池水溶氧量，有助於有機性毒素的氧化。