地下水中的鐵和錳都是構成土壤和岩石的天然成分，地表水中含有溶解氧，鐵錳主要以不溶解的Fe(OH)3和MnO2狀態存在，所以鐵錳含量不高，而地下水中的鐵、錳常以二價的形式存在，故含量較高。二價鐵在水中的溶解度較大，一旦由地下抽至地表時，易被水中的溶解氧氧化而形成難溶於水的三價鐵的氫氧化物，當水中鐵的含量大於0.3毫克/升時，水會變濁；超過1.0毫克/升時，有鐵腥味。二價錳被水中溶解氧的氧化速度較慢，一般不會使水變渾，但它的沉澱物著色污染能力比鐵強。
鐵和錳為魚類重要的微量元素，鐵和錳在魚體內除作為酶之輔基成分或酶的激活劑外，也構成魚體軟組織中某些特殊功能的有機化合物。魚類生活在水中，水中的無機離子可經由飲水、滲透及離子交換等被魚體吸收，淡水魚類的鰓細胞可被動地吸收水中的無機離子，而海水魚類則透過飲入海水的方式由腸道吸收無機離子。而鐵和錳對魚的影響，如魚體中的鐵過量，會產生鐵中毒，導致生長停滯、食慾不振、腹瀉及高死亡率等，同時亞鐵鹽具有很強的氧化性，和銅、鋅及錳間存在著複雜的相互關係，因而魚體內的鐵過多時，也會影響其他元素的利用。至於錳元素對魚體健康，則尚未有危害的報導。
目前臺灣的「水產用水水質基準」並未列出鐵和錳的標準，而日本「水產用水水質基準」規範鐵和錳應在1.0毫克/升以下為宜。