目前水產用光合菌以紫色細菌為主,顏色呈粉紅色、紅色或紫紅不等。市面上有許多水產用光合菌產品可供選購,請參照其建議方法進行培養、使用和保存。本所海水繁養殖研究中心也提供光合菌作為推廣,以本中心所推廣之光合菌為例,將菌種以4-5倍的比例稀釋,提供200-400 ppm魚溶漿作為營養鹽,保持水體均勻混合,在白天光照充足下,培養約7-10日後呈紫紅色即可,若將菌液冷藏,則可保存1-3個月左右。