目前應用在水產的主要益生菌包括硝化菌、光合菌、枯草桿菌、乳酸菌及酵母菌等。硝化菌、光合菌及枯草桿菌有助於分解缸內養殖生物之排泄物、有機物質、抑制病原菌及改善魚蝦生存環境。而乳酸菌及酵母菌主要添加於水產生物的飼料中,提高魚蝦的成長及抗病力。因此,應用於觀賞魚的益生菌產品亦可以使用在觀賞蝦。