本所澎湖海洋生物研究中心長期投入澎湖周遭海域之海洋研究，領域包括漁業、養殖與加工等，累積了豐富多元之海洋生物多樣性的資料，內容涵蓋了海域環境、物種資訊、棲地保育與產業應用等諸多成果。為了整合呈現澎湖海洋生物研究中心的研究成果，本書由澎湖中心同仁，另邀請行政院農業委員會特生中心蔡奇立博士（軟體動物）、自然科學博物館姚秋如博士（哺乳類），以及陳久林先生（爬蟲類）襄助，共整理了澎湖常見或重要的物種255種，其中包括了藻類47種、珊瑚30種、軟體動物37種、棘皮動物28種、甲殼類54種、魚類48種、爬蟲類5種、哺乳類6種…等，撰寫的策略，儘量跳脫學術描述方式，結合了生物、生態、產業等面向，以科普教育的角度來呈現。