我國行政院農業委員會於92年11月21日公告自93年6月1日起全面禁止動物使用硝基呋喃類之動物用藥品。依據行政院衛生署「動物用藥殘留標準」，禽產品中硝基呋喃類動物用藥代謝物之殘留規定均為「不得檢出」。
另，依據動物實驗結果顯示，孔雀綠會毒害實驗動物的肝臟，導致貧血和甲狀腺異常及引發腫瘤等，為避免該藥物對人類健康造成危害，美國、歐盟、加拿大等國均禁止使用於供人食用之養殖水產動物；依據我國衛福部「動物用藥殘留標準」，水產品中孔雀綠及還原型孔雀綠之殘留規定均為「不得檢出」。
再查食品安全衛生管理法第十五條第三款之規定－甲醛非屬食品添加物，食品中不得檢出。然生長在海水中的魚，會利用氧化三甲胺 (trimethyl amineoxide, TMAO) 來平衡體液與體外海水的滲透壓差，而TMAO會分解產生甲醛，包括鯊魚等海水魚，會有一些內源性的甲醛，其濃度會隨水產品種類、新鮮度及海域等不同而有差異。所以水產品中甲醛天然含量背景值隨水產品種類不同而有差異，一般而言，魚體內之TMAO不超過50 ppm (5 mg/100 g)。
此外，組織胺常出現在不新鮮的水產品中，會導致過敏性食物中毒，最常發生在食用鮪魚、鯖魚、鰹魚等鯖科魚類，一般也把它通稱成「鯖科魚類中毒症」(scombrotoxicosis)。主要是因為這些魚種的魚體內含有高量的組胺酸 (histidine)，當魚體因為保存不當遭到細菌污染時，細菌會把魚體內的組胺酸分解成組織胺。當魚肉組織胺含量在20 mg/100 g以上時，便會有組織胺中毒之風險。目前我國尚未訂定限量標準，美國食品藥物管理局 (FDA) 規定水產品中組織胺含量不得超過50 ppm。