臺灣東部緊鄰西北太平洋，在北太平洋環流系統中，黑潮是其中最為重要的西方邊界流，源頭來自菲律賓東方的北赤道洋流，受地形及科氏力等因素之影響，沿菲律賓東岸轉向北流，主軸沿著臺灣東岸向北或北北東移動至日本海域，另有一支流從臺灣西南部進入臺灣海峽。黑潮經常被稱為重要經濟性魚類的藍色高速公路，特別是許多高度洄游魚類，洄游行為與黑潮密切相關。