自從資訊科技普遍應用以來數位化技術、資訊通訊科技與網路的發展對社會的影響日益深遠，因而揭開了社會文化、教育學習全面變遷的數位時代序幕。有鑑於此，行政院國家科學委員會在2002年首度成立了「數位典藏國家型科技計畫」與「數位學習國家型科技計畫」，其目標是將國家典藏文物數位化、提升全民數位學習素養、推動新一波數位學習學術研究、奠定國內數位學習與數位內容產業。而本所通過遴選，自2004年起開始參與數位典藏計畫，將所典藏之台灣沿近海海洋生物標本進行數位化，並與中央研究院台灣魚類資料庫、世界魚庫 (Fishbase) 以及全球生物多樣性資訊機構 (GBIF) 接軌。