Van Dyne在1969年即提出生態系管理 (ecosystem management) 之想法並首先應用在陸域生態系上，但以海洋生態系為基礎之漁業管理概念 (ecosystem-based approach) 卻一直到近幾年才漸漸受到重視。過去制訂漁業管理方法通常是根據單一物種的資源評估結果，而且僅聚焦於該物種的開發強度與永續利用，然而從生態系中移除單一物種的生物量不僅會危及該物種的生存，也會透過捕食－被捕食的關係影響到食物網上的每一個物種。聯合國糧農組織在2003年特地針對以生態系為取向之漁業管理方法 (ecosystem approach to fisheries, EAF) 提出一系列的觀點和管理建議，顯示漁業管理已經由單一物種的管理轉變為以整個或部分海洋生態系為基礎來進行的資源管理模式。