超過400年歷史的淺坪式魚塭是臺灣傳統虱目魚養殖模式，隨著深水式集約養殖的興起而逐趨沒落，目前已不常見。本所海水繁養殖研究中心為了養殖文化的傳承，特別保留了30多公頃的淺坪式魚塭，在冬季休養期間，經常會吸引百隻以上的黑面琵鷺前來覓食和棲息，除了創造養殖與休閒產業的雙重價值之外，也對生態保育做出了正面貢獻。
傳統的淺坪式魚塭水深通常不會超過60 cm，養殖期間利用廉價的米糠、豆餅等有機肥料和太陽能所孕育的藻類作為餌料，生產健康的綠色水產品。淺坪式養殖的工作時序通常依循節氣進行，11月到翌年3月為整池、準備階段，4月以後分批進行放苗與養成，6、7月起陸續收成，最遲至10月收獲完畢。收成後將水位放低，進行數次的曬坪、注水與施肥，以培養底藻，此時池中殘存的下雜魚蝦或其他底棲動物，就成為黑面琵鷺等候鳥的最佳食物來源，經常會吸引大批的嬌客前來覓食。