底棲生物 (benthic fauna, benthos)，泛指生活在水域底質的動物的總稱。部分物種固著在硬底質環境的表層，例如珊瑚、藤壺及岩牡蠣等生物。當棲息環境受到人為或天然性的突發事件 (全球暖化、海水酸化、寒害及水質污染等) 所影響而改變時，底棲生物大多會受到傷害或是面臨死亡 (珊瑚白化、綠牡蠣等)。棲息在泥沙軟底質的海岸潮間帶底棲生物又可以分為底內生物 (infauna) 和底表生物 (epifauna)，其共同特徵是成體的移動能力相對較低。因此，生物的種類、數量、群聚結構受到底質有機質含量與粒徑大小等環境特徵高度的影響。