台東分所試驗設施擴建工程自1999年8月27日開工以後，歷經1年2個月的土木興建，研究大樓及水族生態展示館之建築結構均已達最高樓層(5樓) 。2000年10月20日清晨吉時於新建研究大樓旁，舉行上樑典禮，廖所長一久院士親臨主持，應邀貴賓有監造單位喻建築師台生、承造商同順營造工程公司林總經理俊賢、福林工程公司孫總經理冠鈺等。另外，總所養殖系趙技正乃賢、總務室馬股長魁生及分所與海農號試驗船全體同仁參加。