為使台灣養鰻工廠化，以達到省水、省力、省空間的目標，台灣省水產試驗所正積極進行自動化超集約養鰻系統的開發。經由本系統自動清洗物理過濾裝置，可將水中大於零點一毫米之固形物有效去除。生產一公斤鰻，用水量3～4公噸，為傳統硬池養鰻用水量之四分之一至五分之一。每噸水可生產20公斤之鰻，約為傳統式者之10倍。養鰻期間，池鰻罹病施予藥物治療處理，難以避免，因此高密度密閉式養殖循環系統中，魚病防治為即將面對課題，待及早研究因應。池水水質改善裝置須加強研發，以配合台灣養殖業深厚基礎，促成斯業工廠化目標。