絮團養殖法所謂的水中碳氮比，指的是水中總有機碳與凱氏氮 (有機氮與總氨氮) 的比值，可分別使用儀器測量分析，但這並不是一件容易的事，因為水中碳與氮廣泛分布在糞便、有機絮狀物、細菌、水、蝦體及池底土層等，不易採樣；再者，一般養殖業者缺乏實驗室儀器設備及技術，也沒有多餘預算送專業實驗室分析。養殖池的碳與氮主要來源為飼料，因此一般業者可依據所投餵飼料的蛋白質含量來估算碳氮比，若要提高碳氮比則可添加含有機碳的相關資材如糖蜜、黑糖及澱粉等，可大致達到調控水中碳氮比的目的。飼料中含50%的碳，飼料蛋白質含16% 的氮，因此不同蛋白質含量的飼料碳氮比如表所示。
不同蛋白質含量的飼料碳氮比
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蛋白質含量(%)
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15
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20
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25
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30
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35
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40
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45
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50
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55
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60
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碳氮比
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20.8
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15.6
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12.5
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10.4
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8.9
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7.8
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6.9
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6.3
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5.7
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5.2
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一般飼料的碳氮比約7－10，而理想的絮團養殖法中碳氮比約12－15，以投餵含35%粗蛋白飼料為例，碳氮比約8.9，如果要調整養殖池的碳氮比達到12，則每投餵1 kg飼料尚不足(12 - 8.9) × 56 = 173.6 g的有機碳，如果是添加含22%有機碳的糖蜜則需173.6/0.22 = 789 g，因此，若以絮團養殖法要維持水中碳氮比為12，則每投餵1 kg含35% 粗蛋白的飼料，需補充789 g的糖蜜。