目前本所並無進行蝦殼加工或推廣工作。由蝦蟹類外殼經過酸鹼高熱處理而得之幾丁質、幾丁聚醣的製品，為近年熱門的產品。附幾丁質的應用資料，請參考。
幾丁質的用途很廣，可作為生醫材料(人工皮膚、外傷敷料、止血劑、隱形眼鏡、手術用線等)，醫藥品、保健食品(調降血壓、降膽固醇、增強免疫力等)，化妝品(防紫外線)，農業(植物生長促進劑、生物性農藥等)以及環保用途等，其中以保健食品的用途最大。膠原蛋白也可用作生醫材料(人工皮膚、食道、氣管、燒傷保護膜等)，醫藥品(膀胱失禁用藥、藥物傳輸系統等)，化妝品，美容以及保健食品等，其中以生醫材料最為重要。
幾丁質的衍生物具有極大發展潛力，年用量在750~837公噸，作為保健食品用途者，1997年日本國內銷售額為620億日幣，台灣地區為25~30億台幣，年成長率為6~10%。膠原蛋白在1993年時全球有12億美元市場，預估到2000年時為40億美元。台灣地區2000年時大約有3~4億台幣市場，其中以食品添加物、化妝美容以及醫藥用途較多。