施放有機肥後，池水本易產生有機氮鹽，其中以氨的毒性最強，其次為亞硝酸根離子。一般而言，亞硝酸根離子對魚類的毒性高於蝦類，主要是亞硝酸根離子易使血紅素中之亞鐵離子氧化成鐵離子，從而降低血液攜氧能力，引起缺氧、發紺等中毒現象。由於蝦類血液中之攜氧物質為血藍素 (銅離子)，因此，亞硝酸根離子對蝦類之危害較不顯著，一般界定之安全濃度為28 mg/L；添加測定亞硝酸根離子之檢測劑後，依試水中亞硝酸根離子濃度不同會呈現深淺不一的橘紅色，來函只提呈紅色，實難判斷其濃度。
取樣時蝦子數量不多，牽涉到放養密度、取樣時間及地點，建議在均勻撒餌後1－2小時再取樣，同時多幾處取樣點；至於餵食次數及時間，視人力及時間而定，以少量多餐為原則。