波爾多液主要是硫酸銅 (CuSO4) 與生石灰 (CaO) 及水調配而成，配好後之溶液是鹼性的。使用於養殖池底後，由硫酸銅解離來的銅離子可能產生Cu(OH)+、Cu(OH)2、CuCO3等銅之錯化合物及與池底中的有機物產生螯合作用，均會使硫酸銅失去其殺菌作用，因此就消毒的觀點而言，使用波爾多液來消毒池底是多此一舉。以生石灰的強鹼以及生石灰加水後產生硝石灰 (Ca(OH)2) 時所釋放出的高溫，就已達到消毒目的。硫酸銅若使用於池底，除非整個底泥完全清除，否則銅會一直殘留在池底，當養殖池底老化，底泥變酸時，銅離子就會被釋放出來，導致養殖生物體內會累積銅，造成藥物殘留的問題，因此不建議使用。