水色是由池水中浮游動、植物的種類與多寡所形成，池中的各項環境都是影響因子，但主要與池中的肥分組成與數量有關。肥分來源大致可分為有機肥與無機肥，有機肥又可分作「生肥」與「熟肥」。「生肥」是指未經發酵的物質如雞鴨糞、茶粕、下雜魚 (主要是作為餌料用) 等，「熟肥」則經過發酵。一般「生肥」的施用方式是採取吊掛式，使其能在池塘中慢慢發酵分解成「熟肥」，以利浮游生物利用，無機肥則是指化學肥料。有、無機肥的效果不同，大抵有機肥形成之水色較為穩定，但組成的浮游生物較複雜，無機肥形成水色較快，浮游生物的組成較單純，但維持時間較短 (管理不善，易倒藻)。一般如果在放養前的「整池」階段，能按步整理操作，進水後水色就會自然形成。較困難的是養殖過程中水色的維持，因此，管理上盡量利用進排水方式維持透明度 (水色濃度) 在20－40 cm左右。