希瓦氏菌 (Shewanella putrefacens) 及潘朵拉菌 (Pantoea sp.) 皆是代謝氨氮及亞硝酸的有效菌種，該菌以不同於硝化菌代謝路徑，將亞硝酸轉化成氨，以氮氣方式釋放到空氣中故稱反硝化，因此不會轉化成硝酸鹽，相對也減少池中藻類營養源，故多用該益生菌容易水色較淡，但不會對養殖蝦類有直接負面影響。使用益生菌主要目的之一是減少池中有機物，不應再施肥增加池塘壓力，養殖池應維持藻菌平衡，所以適量施用益生菌，適時適量投餌才能有效管理水質。