吳郭魚性別決定除了染色體基因外，同時受到體染色體修飾基因和環境的影響，這顯示吳郭魚的性別決定機制的複雜性，不能只用單基因染色體 (sex chromosomes) 遺傳來說明，所以性染色體 (XX、XY或YY) 無法從外表判別，須進行一連串的正、反交配及子代測試，過程要耗費很大的人、物力及時間。
純種是很難定義的一件事情。對於品種的判別通常需要長期的接觸及數十年經驗的累積，很難用文字加以形容。
建議至本所網站http://www.tfrin.gov.tw→出版品→水產技術手冊→水產養殖手冊→吳郭魚養殖 (作者：劉富光)，查閱相關資料。