光合菌的顏色主要是含有類胡蘿蔔素 (Carotenoid) 所致，有研究顯示，不同的光源會影響光合菌成長。比較8種光源對光合菌 (Rhodopseudomonas palustris) 生長之影響，結果顯示，LED藍光 > 白熾燈 > 鹵素燈 > 螢光燈。另外亦有研究指出，光源波長會影響光合菌成長與總類胡蘿蔔素含量：以460－470 nm波長的LED藍光對R. capsulatus有最高的吸收強度，因此有最好的生產表現。
至於日光燈與黃燈泡培養出來的光合菌，因燈泡光源不同 (波長)，而改變培養出來的顏色，目前尚無相關文獻。
參考文獻
1. 郭甫旭 (2008) 不同光源對光合細菌生長及類胡蘿蔔素含量的影響。國立臺灣海洋大學水產養殖學系碩士論文，65 pp。
2. 鄭偉凡 (2011) 不同光源對三種光合細菌 Rhodopseudomonas palustris, Rhodobacter sphaeroides, Rhodobacter capsulatus生長及類胡蘿蔔素含量與組成之影響。國立臺灣海洋大學水產養殖學系碩士論文，94 pp。