本中心目前並無實際處理過貝蚤孳生的經驗，貝蚤是介形蟲的俗稱，經查閱相關資料，由其消化道中食物泡的顏色判斷貝蚤應以附生藻為主要食物，數量過多才會對養殖生物造成影響。一般建議的處理方式為：(1)混養會攝食貝蚤的魚或蝦 (部分水族同好有提到網球蝦、小娃娃魚、鬥魚幼魚等)，但須考慮是否會對您的養殖物是否造成威脅或傷害；(2)換缸或清缸，養殖器材及濾材徹底乾燥後使用；(3)新進之水生物或水草須先蓄養於隔離缸數日後再放入養殖缸 (或系統)。另外也有水族同好提到採用誘捕方式也可移除部分貝蚤。
至於您提到蝦子脫殼的殼薄且破碎，由於您是在室內飼養蝦子，除飼料營養外，光照 (或日照) 不足也有可能導致上述情況。