研究發現，水中氨氮濃度在0.280 ppm時，會使文蛤幼貝的濾食率降低50%。而氨氮對海水貝類之96小時的半致死濃度 (LC50) 為3.3－6.0 ppm，顯示文蛤對氨氮的忍受能力高於一般魚蝦。
硫化氫為具溶解性、有臭味且毒性很強之氣體，在水中會解離成HS-和S2-，而只有未解離的硫化氫 (H2S) 具有毒性。在pH 9時，幾乎99% 之硫化物以HS-之形式存在；pH 7時，則HS-和H2S之比例為1 : 1；但在pH 5時則幾乎99% 為H2S。在25℃環境下，硫化氫對文蛤之96小時的LC50為1.5 ppm，由此說明了文蛤對硫化氫之抵抗力頗強，這可能與文蛤長期生活於含有多量還原態硫化物之底泥環境有關。
束井水含大量氨氮，不可能建議用於藻類濃度高的文蛤養殖池，因會加速藻類增生。至於雨季時，若引用水源之鹽度過低，為提高池水鹽度，束井是一種較有效的方法。