魚蝦混養目前以主養虱目魚混養白蝦為多，可與白蝦混養除虱目魚外，鯔科魚類之烏魚及豆仔魚，俗稱金錢魚、變身苦的黑星銀魚共，臭肚魚科之星點臭肚及網紋臭肚魚，俗稱富貴魚之圓翅燕魚等，是較具經濟價值可與白蝦混養之魚種。草蝦和斑節蝦由於臺灣目前尚無SPF蝦苗上市，單養成功機率低，目前以主養魚類混養草蝦為多。魚蝦無交叉感染病原，魚蝦混養或輪作可改善疫情，合理的放養密度及低混養量，是不錯的養殖方式。