目前臺灣各地魚市場拍賣魚貨之時間，受到漁獲量、漁區、季節、魚種和人力之影響，有的每天拍賣一次，最多二次，有的在凌晨3～4點拍賣，有的則在上午(及或)下午拍賣；此外，魚貨品質衛生檢驗人員大多是兼職，無法確實地執行檢驗業務，為亟待解決的問題。
為了落實檢驗業務，在微生物檢測項目和方法上，有必要做適當的調整。本講義將先敘述微生物檢測須知，使檢驗人員對它有正確的認知和做法；然後說明檢測生菌數、大腸菌群和糞便大腸菌群等衛生指標之意義和目的，檢驗流程及其細節和注意事項。希望能夠建立檢驗人員的信心，順利執行此一業務。