臺灣文蛤自1989年人工繁殖成功後，養殖面積如雨後春筍般地快速增加，繁殖技術發展了近40年，已相當成熟穩定。但近年來文蛤種苗生產出現不穩定現象，育成率偏低，增加不少養殖成本。造成生產不穩定的原因包括極端天氣 (強降雨、高溫、日夜溫差大)、環境污染和品系不穩等。另，現有文蛤繁殖場大多歷經數十年之長期運作，過濾設施的污染與過濾能力早已無效，再加上繁殖設施受污染，繁殖技術未依隨環境變遷而調適 (如藻類培養模式)，以致影響了文蛤的種苗生產品質。