海鱺是台灣箱網養殖產業的主要魚種，但近年來，陸續發生養殖過程中，易感染疾病、早熟、成長遲緩及畸形等問題，影響產業發展甚鉅。台灣的海鱺繁養殖技術是在1990年建立，透過捕捉野生種魚，經人工催熟及授精而得，由於人工養殖海鱺二年即具有繁殖能力，故往後繁殖場所使用的種魚均由此而來，到目前已經近親繁衍超過10代，這造成養殖魚種的基因歧異度降低，子代出現成長遲緩、畸形率增加、易罹患疾病、早熟等結果。
多年來，農業委員會水產試驗所(以下簡稱本所)著手進行海鱺育種繁殖計畫，盼透過種魚選育以繁殖優質的海鱺魚苗，並推廣予繁養殖業者，增加養殖效益。首先從天然海域中捕捉野生海鱺，移入本所陸上池塘中馴養培育，待成熟後進行繁殖及育苗試驗，對培育出的海鱺仔魚進行各種測試，再篩選抗病性強及成長迅速的海鱺子代作為種魚，以改善種魚品質。
結果顯示，野生海鱺繁殖的魚苗，在剛孵化階段，畸形率僅為5.67% (一般近親化魚苗為17.67%)。孵化後25天畸形率僅0.06%，遠低於一般近親交配的仔魚(6%)。另外，在飼料效率及對發光菌抗病力表現上，同樣是野生海鱺繁殖的子代有較好的表現。上述結果顯示，野生海鱺交配繁殖的子代具明顯的生長優勢，可有效解決海鱺養殖上面臨的問題。
目前已有魚苗透過技術轉移供給養殖業者試養，未來本所將持續進行海鱺選種、育種及保種的研究，協助解決養殖上的問題，以促進海鱺養殖產業發展。