馬祖海域環境和水質良好，孕育許多優質的水產品，國人愛吃的淡菜就是其中之一，每年的8－10月是淡菜最肥美的時節，然而，野生的淡菜已供不應求，故目前主要在南竿、北竿海域之淡菜多為人工養殖，以浮球、網袋組合的延繩垂式進行放養。
馬祖淡菜的外型為長卵形，殼色為深褐色或黑褐色，外殼上常見有藤壺附著留下的白色鈣質外殼，淺棕色點狀的足絲板 (byssal plaque) 及線狀的足絲 (byssus)。足絲外觀看起來是雜亂一束束的線，實際上淡菜在強勁海流中靠足絲附著在礁石等固體，足絲碰觸固著的地方就會形成足絲板。足絲不可食用，在餐桌上是看不到有足絲的淡菜，因足絲清除之後，淡菜很快就會死亡，所以通常在料理前才會進行清理，以保持其新鮮度。
淡菜還有一個特殊處，其於離水後，雙殼不會緊閉反而會呈現微開的狀態 (圖2)，經刺激才會將雙殼閉上，和其他常見的文蛤、海瓜子離水就將雙殼緊閉的狀態不同，雙殼微張的淡菜仍是活的，因此，可以利用閉起雙殼的活力來判斷淡菜是否死亡。
本試驗利用分子鑑定技術，分析馬祖養殖淡菜種類，並與市售淡菜產品進行比較。