吳郭魚為臺灣重要的養殖物種，以往慣行方法為追求單位產量提升，以增加放養密度和高成長魚種來換取養殖產能，反而忽略維持養殖環境穩定、減低養殖動物緊迫及周遭環境的生態平衡。近年來因氣候變遷，水溫及鹽度的劇變易造成養殖動物緊迫而誘發疾病，因疾病而影響養殖效益成為吳郭魚養殖永續發展的主要問題。以往的解決方式是利用藥物控制疾病以降低死亡率，而吳郭魚飼料中添加抗生素，不僅增加飼料成本約10%，且有抗藥性等衍生問題。因此，應用益生菌預防及控制養殖吳郭魚疾病日益受到重視，可以改善養殖環境、抑制病原菌的生長、提高養殖動物成長性能和飼料效率、增強抗病力、提高動物緊迫抵抗力和整體活力，對改善水產動物體內外環保有重要的作用。然而目前水產養殖業者施用益生菌的方式，多以粉溶水拌合吸附於飼料後投餵，但也因而致使微生物添加物的高流失性及人力成本增加，再者可資應用的益生菌品項繁多，其生物特性及有效活性、添加於飼料的方法及劑量、保存方式與期限各自不同，以致應用成效不穩定。
本研究為於飼料製程中添加複合益生菌，且維持一定的生物活性，以本所研發的短小芽胞桿菌D5 (Bacillus pumilus D5) (黃等，2016) 及腸膜明串珠菌 (Leuconostoc mesenteroides B4) 含葡聚醣 (黃等，2017) 等多功能之益生菌，透過飼料包覆製程並經菌株活性確效，與生技公司及飼料廠合作，共同商業化量產益健飼料，於所內建置吳郭魚養殖驗證場域，以有效增加成長率、活存率及抗病力，以求達到減抗和增進養殖效益之目標。