生物多樣性的觀念，是當前全球的潮流，世界各國莫不有計畫的積極落實執行。養殖經濟水產生物或本土原生水產物種也是生物多樣性的一環，自不能置身事外。因此，水產生物，不論經濟性養殖物種或非經濟性保育物種的保種工作就顯得格外重要。此外，由於生態環境遭受破壞、河川水域受到污染，人為不當捕撈及外來種的入侵等，造成本土性水產生物族群之減少，甚至有瀕臨滅絕的危機，實在有必要建立水產生物種原庫以保存優良種原與遺傳資源，並經由選種、育種之研究，保存、改良或開發新品種，以達到養殖品種多樣化與永續利用之目標。
種原庫運作的主要工作不外選種、育種與保種。在選種方面，只要先鑑定種名，然後瞭解其生理、生態及相關養殖特性後，便可把種選好，由於這方面的技能較不成問題，所以在此不加贅述。本文旨在闡述：在育種方面，如何利用選擇育種、雜交育種以及標誌輔助育種方法；而在保種方面，如何確保有效族群數量，以避免近親交配導致的近交衰退等理論觀念，希望對水產生物種原庫的營運規劃，有參考借鏡之處，俾利種原庫運作之順利推展。