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為掌握國內相關科技組織之經營品質與績效表現，國科會與其它有關單位組成研究機構評鑑小組，對執行研究發展之研究機構，每3年進行一次研發績效與能量評鑑。評量內容包括組織發展、管理制度、人力資源及技術面績效。