本所東部海洋生物研究中心 (以下簡稱東部中心) 附設水族生態展示館 (以下簡稱水生館) 委外經營案，業經中華民國仲裁協會作成仲裁判斷，雙方契約於2008年8月5日終止。為維持水生館之社教功能及維護社會大眾權益，乃變更目前展示內容，轉型為研究型水族館，除社會教育外，同時具備水產研究功能，期許此次的轉型經營，能為美麗的東海岸注入觀光活水，並促進海水觀賞魚研究之發展。