底土有機物來源池塘沈澱物的來源有飼料殘餌、養殖生物的糞便、死亡的浮游生物、空氣中的碎片、侵蝕的土壤和微生物。由於沈澱作用使有機物質沈積在池底，沈澱物富含營養鹽和有機物。在池底營養物 (包括有機碳水化合物) 的濃度要比水中高出好幾倍。水下1 cm的底土層所含營養物要比1 m深的水層高出10倍或更多。而營養鹽和有機殘餌累積在池底，若超過池塘沈澱物的負荷能力時，會破壞池塘的生態系統。如此的發展對蝦類特別有影響，因為蝦類大多數時間生活在池底，在土壤中潛伏及攝食。無氧狀況容易發生在集約養蝦池底，養殖的密度愈高池底無氧狀況愈明顯。而無氧狀況會抑制生產量同時也是更高密度養殖的障礙。